阿克迪娜女王在灾难爆发之前，就通过情报机关察觉了克鲁泽元帅的异动，并且竭力调集了一支8万人的军队，从下游乘船溯流而上，前来库斯科城前线镇压叛乱。但船队抵达时已经晚了一步，库斯科城的30万精灵军全都变成了僵尸，被救回的健康官兵寥寥可数。
雪上加霜的是，正在麻麻里河峡谷上游布防的印加人和巨熊军团，也察知了这一异变。在狂喜之余，他们决定再接再厉，先是从上游施放了许多漂雷，把拥堵在狭窄河道内的精灵船队炸得够呛。然后又用魔法筑坝的方式，在峡谷中制造出一场规模空前的大洪水，从而彻底葬送了精灵女王的船队。
经过此次浩劫，囤积在库斯科城的三十多万精灵军一日全灭，而精灵女王召集的八万平叛部队，最后也只剩下了一万余人的残部，精灵王国在马兹卡大陆的军事力量为之一空，攻防形势瞬间逆转。
而精灵王国末期最著名的将军丹尼尔，却趁乱逃出监狱，并且混上了女王的座舰，从而逃出生天。
5.“不死鸟”的大进军
在库斯科城的浩劫之后，深受鼓舞的特库姆塞大王，在高原上大肆招募勇士，准备集结起一支规模空前的大军杀下高原，一举将精灵军赶出马兹卡大陆。
最后，凭借昔日的威望，他搜罗到了25万装备落后的军队，对外则号称50万大军，但却有至少100万家眷随军行动，看上去并不像是正规的出兵打仗，倒像是古代的野蛮部落在集体迁移。
在短暂的一周时间内，这些夹杂了许多乌合之众的精锐战士……确切地说，是搀杂了极少数精锐战士的乌合之众，被紧急整编成若干个战斗群，然后沿着麻麻里河的主干道，水陆并进，浩浩荡荡杀下饥荒蔓延的贫瘠高原，如同秋风吹过草原一般，直奔东方那片广袤富饶的热带雨林而去。
不过，印加军队的阵容固然不佳，但精灵王国的形势更加糟糕。
在经历了库斯科城下那场毁灭性灾难之后，精灵王国在马兹卡大陆的军事力量，已经空虚到了无法维持基本治安的地步，连武装侨民和土著警察都找不出来了。
由于昔日的积怨，殖民地范围内那些半独立的土著城邦，谨慎一点的宣布局外中立，拒绝向精灵军提供任何补给与劳力；而彪悍一点的干脆直接扯旗造反，在印加人杀到之前，就已经将己方地盘内的精灵殖民势力清理一空。
精灵女王的船队沿着麻麻里河向下游撤退，几次想登陆建立防线，但却总是被土著人打出来，最后只能一路撤到了出海口附近的三角洲平原，才勉强站稳了脚跟。
因此，特库姆塞大王的此次进军异常顺利，除了在蒂卡尔城遭遇一定抵抗之外，几乎是兵不血刃地占领了除河口三角洲和东部海滨之外的整个大陆。直至交通不便的雨季到来，才暂时停下了进军的脚步。
DR1992年6月，特库姆塞在蒂卡尔城举办了盛大的阅兵式，以炫耀自己卷土重来的辉煌武功。
但他为了维持庞大军队的消耗，在阅兵式之后，趁机对热带雨林各部落摊派的沉重赋税和劳役，却使得他作为“解放者”的光环大为失色，激起了低地土著玛雅人的强烈不满，也为日后的反目埋下了祸根。
在此期间，祥瑞号和巨熊军团均未参加多少战斗，主要是承担运输船的任务。
6.特诺奇蒂特兰城突击战
DR1992年的雨季后期，为了达成战术上的突然性，特库姆塞不顾暴雨尚未平息，强令祥瑞号顶着洪水和大雨顺流而下，运载科曼特将军率领的6000印加禁卫军和菲里的2700巨熊军团士兵，强袭位于三角洲顶点的阿兹特克帝国旧都特诺奇蒂特兰城，企图打开这扇攻入麻麻里河三角洲的门户。
此时，精灵女王已经翻出所有家底，在特诺奇蒂特兰城布置了2万精灵军，理论上应当固守无虞。
但事实上，精灵殖民当局仍然未曾从库斯科城的亡灵之灾之中恢复过来，后方的永聚岛又再次爆发政变，在殖民地内部也有叛党同谋参与，三角洲内部的土著人同样在纷纷起义，导致整个军政体系和防务部署一片混乱，特诺奇蒂特兰城的前沿部队补给困难，时常有腹背受敌的危险。
更糟糕的是，由于精灵军上层的反复扯皮争斗，以及精灵女王本身的犹豫不决，后迁到通贝斯港的精灵军大本营，迟迟未能确定前线的最高指挥官人选，结果就造成了指挥系统的极度紊乱——特诺奇蒂特兰城的区区2万军队，却来自于大大小小30多个互不统属的单位，由超过25名中校、上校、少将和中将分别掌管，没有一个最高司令官。
这些部队平时就冲突不断，打起仗来之后更是很快就彻底散了架。
于是，特诺奇蒂特兰城的2万精灵军，在交战之中一触即溃，特诺奇蒂特兰城迅速陷落。
巨熊军团还解救了关押在附近战俘营内的2200名耐色瑞尔帝国军战俘，从而得到了宝贵的兵力补充。
与此同时，面对军队瓦解、国家崩溃的空前危机，为了获取掌握在旧军政府手中的15万东方军，精灵女王不得不放低姿态，与薛佛拉斯教会的旧军政府残党进行和谈，试图结束内部争端，协力对抗外患，并且取得了一定成果。
但这支援军毕竟还在大洋彼岸，一时间远水难救近火。
在特诺奇蒂特兰城陷落之后，进驻该城的印加禁卫军派出大批使者，游说三角洲地区的各大土著部落联手反抗精灵殖民者，很快就掀起了轰轰烈烈的全面起义，到处杀戮精灵侨民，焚烧他们的庄园和别墅。
面对这种全盘崩坏的情况，阿克迪娜女王和她的大臣们几乎是束手无策。
特诺奇蒂特兰城的迅速陷落，导致前线精灵军本来就已经非常低落的士气，进一步走向了崩溃解体，天天都有成百的士兵干掉长官携枪夺船逃亡。在道路几乎断绝的雨季里，派遣这样的军队出征讨伐，只能是给叛乱者提供更多的武器、弹药甚至兵员。
最后，女王只得下令全体精灵侨民退入王室驻跸的通贝斯港固守，精灵殖民当局的统治范围进一步萎缩，在整个麻麻里河三角洲地区，基本只剩下了这么一座孤城。
雨季结束之后，特库姆塞依靠一路招降纳叛，纠集起一支50万人的大军进驻特诺奇蒂特兰城。但他并没有选择继续北上，与通贝斯港的最后那支精灵军一决雌雄，而是在特诺奇蒂特兰城稍事休整之后，就将大军分成几路，沿着滨海大道呈扇形展开，直扑空虚而富庶的东方沿海诸多港口城市，计划上演又一场以和平接收为主要内容的“胜利大进军”。在后方只留下科曼特将军带着35000人坐镇三角洲。
然而，就在这个双方对峙的阶段，通贝斯港的精灵军又一次爆发了内部问题。
7.第一次通贝斯港会战
DR1992年的8月初，退入通贝斯港的精灵军再次爆发哗变，大约2000名矮人士兵突然以武力控制了码头、海岸炮台和若干艘远洋货船，并且劫持了图卢斯元帅和几乎整个精灵海军参谋部充当人质，与前来平叛的精灵军对峙五天之久，最后在混战之中，这些矮人叛军带着所有人质玉石俱焚，也让港内的精灵军在内讧之中到了瓦解的边缘。
坐镇特诺奇蒂特兰城的科曼特将军，趁机挥师北上，直扑通贝斯港，轻易瓦解了城市外围的防御体系——守军都在内斗之中被缴械整肃了——然后杀入市区，与精灵军残部展开艰苦的巷战。
由于此时的精灵军还有一定实力，印加军一时间久攻不下，科曼特将军便带人前往最新占领的几座炮台，让人调转炮口轰击敌阵……结果却因为炮台塌方而横死，攻城部队也在失去指挥之后溃散逃亡。
虽然勉强击退了第一波攻城队伍，但此时的精灵军也已经濒临油枯灯尽，弹药和兵力都已经枯竭。当夜，巨熊军团抵达通贝斯港，裹挟大批土著起义军发动第二波攻城作战。
而负责城防的丹尼尔中将竭尽所能，也只集结起一支700人的军队，在进行了最顽强的抵抗之后，眼看着力不能支、败局已定，只得掩护王室成员上船避难，放弃了通贝斯港这个最后的据点。
至此，精灵军对马兹卡大陆的殖民统治基本宣告结束，但这片土地上的战火却依然没有熄灭。
8.玛雅人的反叛
在通贝斯港陷落的同时，特库姆塞也顺利“接收”了整个东海岸地区——精灵侨民早已撤走或被杀，本地土著则是被他的军威吓得噤若寒蝉。
进军路线上的每一座城市，都自觉主动地打开了大门，献上鲜花、水果、醇酒、佳肴、财宝和最美丽的少女，用以热情款待这些“送来自由的解放者”，惟恐有什么地方伺候得不够周到。
但是，在这一片军民联欢的热烈氛围背后，却是暗流涌动、阴谋隐现。
——作为所有印加人、玛雅人和阿兹特克人共同拥戴的反抗武装盟主，特库姆塞大王在名义上早已是整个马兹卡大陆的合法统治者。但事实上，在这个囊括马兹卡大陆所有原住民的松散联盟之中，印加人、玛雅人和阿兹特克人三大民族之间，乃至各民族的内部，自古以来都是矛盾冲突不断，语言文化各不相同，根本就没有过什么统一国家的观念。
仅仅是基于精灵殖民者这一强大而残暴的共同敌人的存在，以及特库姆塞大王奇迹般的煊赫武功，这么多部族才能勉强放下彼此仇怨，暂时团结在特库姆塞的黑鹰军旗之下携手抗战。
这个时候的特库姆塞大王，虽然正处于他一生戎马倥偬、征伐四方的功业顶峰，看上去仿佛威风八面，其实在根基上却是空虚到了极点——他所扎根的大后方，那片养育着所有印加人的雪域高原，已经在一系列天灾人祸的打击下，逐渐陷入了规模空前的全面动乱之中，再也不能为出征在外的军队提供多少支援和帮助。反倒是需要远征军设法在刚刚饱受战火蹂躏的新占领区搜罗各种物资，以解救后方故土的饥谨……毫无疑问，这必然会遭到刚刚被“解放”的热带雨林居民们最为激烈的抵制。
——由于精灵殖民者的迅速溃退，马兹卡大陆原住民独立自主的曙光似乎就在眼前，这一广泛联盟成立的最根本基础，也就从此不复存在了。相反，各地部族之间的内部矛盾和冲突，却开始一点点愈演愈烈，逐渐被正式摆上了台面——其根源就是独立之后的政权之争。
在这个时候，特库姆塞大王真正可以视为依靠的，只有从雪域高原带下来的二十多万本族战士，以及一路随行的一百多万故土移民。这个数字看起来似乎很是庞大，但假如把他们分散在从库斯科到东海岸的广袤范围内，总人口超过两亿的玛雅人和阿兹特克人中间，顿时就仿佛茫茫沧海中的沙砾，几乎连个浪花都翻腾不起来了。
于是，看到“解放者”已经完成了驱逐精灵的历史任务，热切希望自己翻身做主，不再侍奉任何主子的热带雨林土著人，便开始以羽蛇神库库尔坎的信仰为纽带，在龙巫教势力的挑唆和串联之下，逐渐形成了一个势力庞大的叛乱集团。而沉醉于胜利之中的特库姆塞大王，却对这迫在眉睫的危机毫无察觉。
于是，在一片欢声笑语中顺利挺进的印加远征军，并非是踏上了一条通往最终胜利的金光大道，而是无知无畏地迈开了大步，走进了一个埋葬自己的致命陷阱。
最终，一场猝不及防的大叛乱，让特库姆塞大王满腔的雄图霸业，在转瞬之间就彻底化作了泡影——数十万玛雅人和阿兹特克人武士夜袭印加军营地，而营地里的内应也及时起兵配合，最终彻底葬送了这支貌似庞大的军队，侥幸未死的特库姆塞大王，仅仅带了数千人突围逃亡。
与此同时，分散在热带雨林其余地区的印加军队和移民，也纷纷遭遇了土著居民的围攻，相继覆灭。
DR1992年9月11日，最后一批残余的印加禁卫军，在特库姆塞大王和阿芝莎公主的率领之下逃亡到通贝斯港，与菲里的巨熊军团会合。此时双方的兵力总和，已经只剩下不足一万人。
再接下来，已经几乎化作废墟的通贝斯港，又再一次遭遇了围攻——这一次的敌人，是亡灵！